Förstå bidraget från kromosomala gener i den intracellulära anpassningen av Shigella – nya virulensfaktorer och potentiella läkemedelsmål

Shigella är en intracellulär bakterie som orsakar shigellos och dysenteri. Varje år dör fler än 200 000 av shigellainfektioner vilket gör shigellainfektioner till den mest dödliga diarrésjukdomen. Endast 10 bakterier är tillräckligt för att orsaka en infektion. Den ökande förekomst av antibiotikaresistens är oroväckande och därför behöver det utvecklas alternativa behandlingsmetoder för att i framtiden kunna bota dessa infektioner.

Shigellas förmåga att orsaka infektioner beror till stor del på dess virulensplasmid. Tidigare studier har därför fokuserat på reglering av generna på virulensplasmiden, medan reglering av de kromosomala generna till stor del förblivit outforskad. Vi har använt två olika metoder för att identifiera kromosomala gener som är viktiga vid infektion. För att kunna bekräfta dessa geners roll vid infektioner har vi utvecklat en uppskalningsbar CRISPR-Cas9 metod som med hög effektivitet muterar gener i shigella.

I detta projekt kommer vi att använda vår CRISPR-Cas9 metod för att verifiera våra kandidatgeners roll vid en infektion. Generna med störst effekt kommer även karakteriseras biokemiskt för att bestämma deras funktion och för att utvärdera deras potential som mål för framtida behandlingsmetoder.

Denna studie kommer leda till en bättre förståelse av hur shigella orsakar infektioner och de gener som identifieras kan utgöra grunden för framtida läkemedel som i slutändan kan komma att rädda många liv.