Storskalig cellväggsprofilering för att upptäcka bakteriespecifika måltavlor för nya antibiotikabehandlingar 

Multiresistenta bakterier (bakterier med ökad motståndskraft mot flera antibiotika) ökar i hela världen och utgör ett stort problem för den enskilda människan, samhället och vården. Därför behövs nya behandlingsmetoder för bakteriella infektioner. De flesta av cirka 30000 studerade bakteriearter har en cellvägg uppbyggd av socker och aminosyror (så kallade peptidoglykaner) som bland annat skyddar bakterien från sin omgivning. Många av dagens antibiotika, till exempel penicilliner och cefalosporiner, påverkar uppbyggnaden av denna cellvägg. Det är dock inte fastställt hur peptidoglykaner skiljer sig åt i kompositionen av specifika socker och aminosyror mellan olika sorters bakterier. I detta projekt ska vi därför undersöka kompositionen av peptidoglykaner i 1000 olika bakteriearter för att sedan klassificera bakterierna utifrån detta. Med hjälp av klassificeringen kommer vi att undersöka vilka proteiner som är ansvariga för uppbyggnaden och omvandlingen av specifika peptidoglykaner, för att hitta måltavlor för nya artspecifika antibiotikabehandlingar. Genom att förstå skillnaderna i cellväggen hos olika bakterier kan dessa nya läkemedel riktas enbart mot de bakterier som orsakar infektionen, till skillnad från dagens bredspektrumantibiotika, t ex cefalosporiner, som kan skada många av mag-tarmkanalens nyttiga bakterier som är viktiga för människans hälsa.