Proteomik med spatial upplösning för studier av mitokondriella störningar

Mitokondrier är cellernas kraftverk och ansvarar för hundratals reaktioner i ämnesomsättningen. I det här forskningsprojektet riktar vi fokus mot mitokondriella enzymer. Uttrycket av dessa enzymer anpassas efter behov och tillgången på näringsämnen och syre i cellen och dess omgivning. Misslyckas mitokondrien med denna anpassning kan det leda till allvarlig sjukdom som organsvikt, immunbrist eller cancer. Vi vet att olika celltyper och organ drabbas olika vid störningar i mitokondriefunktion men vår kunskap kring varför vissa celltyper är mer sårbara än andra är fortfarande begränsad. Proteomik är en metod för att analysera och kvantifiera tusentals olika proteiner samtidigt. Tack vare nya teknologiska framsteg kan vi med hjälp av spatial proteomik integrera information om enskilda cellers proteinuttryck med information om cellens rumsliga kontext i vävnaden. Vi kommer att (1) Implementera metoder för proteomik i enskilda celler och spatial proteomik; (2) Kartlägga proteomiska förändringar i olika celltyper och organ med hjälp av etablerade musmodeller; (3) I patientvävnad undersöka biologin bakom de celltypspecifika effekterna av störningar i mitokondriens funktion med spatial proteomik. Genom att studera proteinuttryck i ytterligare en dimension, den rumsliga, kommer vi få helt nya insikter om mitokondriedynamik och sjukdomar kopplade till försämrad mitokondriefunktion. Detta öppnar upp möjligheten för nya, anpassade och mer specifika, behandlingsstrategier.