Spatial multiomics av kärnmetabolism i genreglering

Kolorektalcancer är den tredje vanligaste cancerformen i Sverige med 6900 nya fall varje år. Utan tidig diagnos kan metastaser uppstå där celler från primärtumören sprids till andra delar av kroppen, en avgörande aspekt som bidrar till de flesta cancerrelaterade dödsfall. Under denna process kräver de snabbt delande och migrerande cancercellerna en stor mängd energi och cellulära byggstenar. De enzymer som producerar dessa byggstenar finns vanligtvis i mitokondrier eller i cellens cytoplasma, varifrån byggstenarna sprids genom cellen. När cancerceller växer och migrerar behövs många av cellens byggstenar i kärnan där RNA transkriberas från DNA för att bilda proteiner för cellens funktion. Metaboliska enzymer kan flytta till kärnan och direkt tillhandahålla byggstenar där det behövs. De kan därigenom reglera vilka gener som transkriberas, vilket ger en koppling mellan cellmiljö och genreglering. Detta projekt syftar till att undersöka vilka metaboliska enzymer som flyttar till cellkärnan i kolorektalcancer och hur dessa enzymer bidrar till genreglering och cellens metastaserande fenotyp. Jag kommer att kombinera proteomiska och genomiska metoder för att avslöja de mekanismer genom vilka de metaboliska enzymerna reglerar cancercellers överlevnad. Huvudmålet är att identifiera potentiella terapeutiska mål för att stoppa cancercellsdelning och migration och förhoppningsvis kunna förhindra cancercellers överlevnad och metastaser i framtiden.